A mitad del año de 1.817 los patriotas venezolanos detuvieron dos embarcaciones de bandera estadounidense, ésto, por haber burlado el bloqueo que se tenía a la entrada y recorrido del río Orinoco, y por estar los dos navíos cargados con armas y pertrechos para surtir a las tropas españolas; a las cuales los venezolanos combatían por la independencia del país. El derecho que tenían los patriotas de apresar estas naves fue considerado por Bolívar procedente y que no tenía discusión posible, ello, por la circunstancia de haber traído armas para el enemigo y de esta manera colocarse en posición beligerante, anulando la calidad de neutralidad en que se declaró el gobierno de los Estados Unidos en el conflicto entre España y Venezuela, por tal motivo Bolívar no las devuelve y las retiene a pesar de que el gobierno estadounidense envía un emisario para procurar las liberen, pretendiendo hacer creer que la venida de su Agente, Bautista Irvine, tiene como principal propósito el reconocimiento por parte de aquella nación de la lucha independentista; sin embargo Bolívar no se deja engañar y mantiene firme la decisión de no liberar las dos goletas y de una manera enfática se lo hace saber a Mr. Irvine en varias oportunidades hasta que cansado de referirse al tema le pide al Agente estadounidense que no insista más sobre el caso.

El 27 de Mayo de 1.819 Bolívar sale con tropas llaneras rumbo a Casanare, Colombia, acción que incluye el famoso paso de los Andes, esta marcha dura 65 días y en el transcurso de ese tiempo tiene que atravesar por lugares inhóspitos, al comienzo ellos extremadamente calurosos y al final con temperatura gélidas y ventiscas que penetran hasta los huesos; esta proeza fue admirada por el mundo entero y reconocida como una de las acciones más osadas de la historia militar universal. Una semana después de llegar Bolívar al lugar escogido, donde descansa un poco y repone su fuerza física, reanuda su marcha al sitio denominado Boyacá y allí combate el 7 de Agosto a las tropas españolas aunque éstas sobrepasan en número a las patriotas, el empuje que en la lucha pone los patriotas y la sorpresa que causa en los españoles la presencia de Bolívar dirigiendo a sus tropas son causas suficientes para infringirles una terrible derrota; esta es la celebre batalla de Boyacá ganada por Bolívar y con la que se libera al territorio colombiano de tropas española en su suelo.

El Congreso de Angostura en febrero de 1.819 había designado a Simón Bolívar Presidente de Venezuela y al colombiano Francisco Antonio Zea, Vicepresidente, de manera que cuando Bolívar sale para Casanare en el mes de Mayo deja encargado del Poder Ejecutivo al Vicepresidente. A finales del mes de Julio Zea, sin consultar con nadie, entrega a los Estados Unidos las goletas Tigre y Libertad, esta acción le trae grave consecuencia, puesto que por ello y otros desaciertos se provoca el primer golpe de estado que sufre la república venezolana y el general Arismendi asume el poder; Bolívar al enterarse del humillante proceder de Zea por la entrega de las dos embarcaciones y por su violenta remoción regresa rápidamente a Angostura.

Simón Bolívar se presenta ante el Congreso y rinde informe de su gestión, en una parte de éste dice: “Cuatro batallas campales ganadas, cuatro millones de hombres devueltos a la libertad y cuatro millones en las cajas del ejército, tal ha sido el motivo de mi ausencia” Inmediatamente el general Arismendi, presente en la reunión, se levanta y responde: “Jamás podremos recompensar dignamente a un héroe que nos ha dado patria, vida y libertad”.

Es ineludible observar como se traiciona la buena fe de Bolívar, él propuso a Zea para que ocupara la Vicepresidente de Venezuela demostrando así la voluntad de llevar a la práctica su concepción integracionista. El 25 de Septiembre de 1.828, en Bogotá, Bolívar vuelve a ser traicionado por otro prominente hombre; Francisco de Paula Santander ordena que ese día se atente contra su vida.